北大蛋白質(zhì)功能設計研究獲新進展——“嫁接”關鍵氨基酸殘基實現(xiàn)蛋白質(zhì)結(jié)合功能。
北京大學理論生物學中心/化學與分子工程學院來魯華教授領導的課題組在功能蛋白質(zhì)設計方面取得可喜進展,其研究成果發(fā)表于近日出版的《美國科學院院刊》(《PNAS》)上。
蛋白質(zhì)在生命活動中占有非常重要的地位,幾乎所有的生命活動都需要蛋白質(zhì)的參與。在功能各異的蛋白質(zhì)履行生命功能的過程中,它們不斷地與其他分子(如蛋白質(zhì)、核酸、小分子等)發(fā)生相互作用。相互作用的兩個蛋白質(zhì),就有如“鎖”和“鑰匙”的關系。鑰匙有各種各樣的形狀,但是只要它們的關鍵部分“齒紋”一樣,就能夠具備同樣的功能——打開同一把鎖。來魯華教授領導的課題組研究的目的,就是將一個蛋白質(zhì)行使功能的關鍵“齒紋”(氨基酸殘基),復制(“嫁接”)到另一個結(jié)構(gòu)完全不同的蛋白質(zhì)上,使后者具有打開同一把“鎖”的功能(和同一個蛋白質(zhì)結(jié)合)。
兩種蛋白質(zhì)結(jié)合時,往往會有少數(shù)幾個非常關鍵的殘基,對結(jié)合起到主要作用。基于這種情況,該課題組發(fā)展了一種“蛋白質(zhì)關鍵殘基嫁接”的方法,用于將一個蛋白質(zhì)的關鍵功能性殘基“嫁接”到另一個不同結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)上,并將這種方法應用到了實際體系的研究中,并獲成功。例如,促紅細胞生成素(EPO)通過和它的受體(EPOR)相互作用,促進紅細胞的分化和成熟。而將EPO上的關鍵功能性殘基“嫁接”到一個結(jié)構(gòu)完全不同的PH結(jié)構(gòu)域蛋白(結(jié)構(gòu)域是一種存在于多種信號轉(zhuǎn)導蛋白和細胞骨架蛋白中的大約由120個氨基酸組成的功能性區(qū)域)上后,PH蛋白便具有了和EPOR結(jié)合的功能,而這種功能在自然界中是不存在的。研究人員解釋說,這種方法有可能得到廣泛應用,實現(xiàn)蛋白質(zhì)功能的自由設計。