豬很可憐，不僅成為食物進(jìn)人類的肚子，我們還指責(zé)它在2012年給人類帶來(lái)了“豬流感”（研究顯示，豬流感病毒也是一種冠狀病毒）。此外，豬還是沙門(mén)氏菌的宿主，這種細(xì)菌可以進(jìn)入人體并引起腸胃不適和傷寒。
不過(guò)，現(xiàn)在看來(lái)，幾千年前似乎是人類首先感染了沙門(mén)氏菌，而后又將其傳染給了無(wú)辜的豬。
據(jù)《科學(xué)》報(bào)道，一項(xiàng)新研究表明，生活在歐亞大陸的早期農(nóng)民，在從狩獵、采集為主的游牧生活轉(zhuǎn)變?yōu)檗r(nóng)耕生活時(shí)，身上已經(jīng)攜帶了一種更為致命的沙門(mén)氏菌。
農(nóng)耕生活方式使得人類不得不與家畜及其排泄物近距離接觸，這讓潛伏在未知?jiǎng)游锼拗黧w內(nèi)的沙門(mén)氏菌很容易進(jìn)入人類腸道，并在那里安家落戶。豬可能就是從人或其他動(dòng)物身上感染到這種病原體的。
長(zhǎng)期以來(lái)，研究人員一直認(rèn)為，從游牧到農(nóng)耕的轉(zhuǎn)變是造成人類更易感的原因。在早期的農(nóng)耕生活中，人類只能依靠少量的農(nóng)作物和家畜為生，相比狩獵、采集，所攝入的食物種類減少，飲食更不健康。當(dāng)時(shí)，人們居住的環(huán)境還未能做到與自身和動(dòng)物排泄物完全分離，而這些排泄物正是病原體滋生的天堂。但是很少有傳染病能夠在骨骼上留下蛛絲馬跡，因此，科學(xué)家很難在化石中發(fā)現(xiàn)病原體的蹤跡。
利用一項(xiàng)技術(shù)突破，由德國(guó)馬普學(xué)會(huì)人類歷史科學(xué)研究所的人口遺傳學(xué)家Felix Key和Johannes Krause，以及細(xì)菌基因組學(xué)家Alexander Herbig共同領(lǐng)導(dǎo)的研究小組，開(kāi)發(fā)了一種名為HOPS的方法，用于從致病細(xì)菌中檢測(cè)其古代DNA片段。
目前，Key和Herbig及其團(tuán)隊(duì)，利用HOPS，從來(lái)自歐洲、俄羅斯和土耳其的2739個(gè)人的牙齒中篩選出細(xì)菌DNA片段，這些牙齒可以追溯到6500多年前。通過(guò)對(duì)這些牙齒的檢測(cè)分析，他們能夠重建8個(gè)腸道沙門(mén)氏菌的基因組。
當(dāng)研究人員將這些基因組歸類到沙門(mén)氏菌進(jìn)化樹(shù)（已有2500種）中后，他們發(fā)現(xiàn)，來(lái)自古代農(nóng)民和牧民的6個(gè)腸道沙門(mén)氏菌基因組都屬于同一種。但是，剩下的兩個(gè)來(lái)源于俄羅斯牧民的腸道沙門(mén)氏菌基因組則屬于其他種類，其中一種能夠?qū)е埋R和羊流產(chǎn)。這種感染人類的菌株存在于5500年至1600年前，其中包括丙型副傷寒沙門(mén)氏菌的祖先，后者能引起一種致命的腸道熱，類似于今天的傷寒。
研究人員在2月24日發(fā)表于《自然—生態(tài)學(xué)與進(jìn)化》雜志的研究中稱，至今，人們?nèi)圆磺宄畛跏悄囊环N動(dòng)物作為沙門(mén)氏菌宿主，將其傳染給人類，但至少不是豬，因?yàn)楦鶕?jù)沙門(mén)氏菌進(jìn)化樹(shù)的分子年代測(cè)定，豬攜帶的沙門(mén)氏菌種類在4000年前才出現(xiàn)。
丙型副傷寒沙門(mén)氏菌的遠(yuǎn)古祖先，那時(shí)還不是特別適應(yīng)人體內(nèi)的環(huán)境：這種病原體感染了許多動(dòng)物，但缺乏引起傷寒的基因。這表明人類最初所患的是一種更溫和的疾病，這種疾病同樣感染了牲畜。
美國(guó)亞利桑那州立大學(xué)人類遺傳學(xué)家Anne Stone希望，研究小組能從人類身上提取更多的腸道沙門(mén)氏菌樣本。但此項(xiàng)新研究，已經(jīng)揭示了細(xì)菌病原體是如何進(jìn)行宿主轉(zhuǎn)移的。她說(shuō)，這可能有助于研究人員更多了解病原體是何時(shí)、為何從一個(gè)物種轉(zhuǎn)移到人類身上的。鑒于目前的新冠病毒疫情，這是一個(gè)及時(shí)有效的研究。
相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1038/s41559-020-1106-9
