保健食品的申報，主要涉及到四種機構(gòu)：檢測機構(gòu)、受理處、評審委員會、衛(wèi)生行政部門。
①檢測機構(gòu)：
負責對產(chǎn)品進行技術(shù)檢驗，并出具檢驗報告。具體為各省、直轄市的疾病控制中心（或衛(wèi)生防疫站）、中國疾病預(yù)防控制中心營養(yǎng)與食品安全所、中國預(yù)防醫(yī)學(xué)科學(xué)院、以及部分醫(yī)學(xué)院校。
②受理處：
負責對企業(yè)的申報材料進行初步審核，材料符合要求則負責安排產(chǎn)品參加評審會；將評審意見通知企業(yè)；對于擬批準的產(chǎn)品上報國家食品藥品監(jiān)督管理局；發(fā)放證書等。具體為各省、直轄市藥監(jiān)局（所）的保健食品審批受理機構(gòu)、國家食品藥品監(jiān)督管理局國家中藥品種保護審評委員會保健食品受理處。
③評審委員會：
負責對申報的產(chǎn)品進行技術(shù)評審。具體為各省、直轄市的初審委員會和國家藥監(jiān)局評審委員會。
④衛(wèi)生行政部門：
對通過了評審委員會技術(shù)評審的產(chǎn)品進行進一步審核，如符合有關(guān)法規(guī)的規(guī)定，則予以上報或批準，最終具有批準權(quán)的是國家食品藥品監(jiān)督管理局。經(jīng)批準的產(chǎn)品賦予保健食品批準文號。