1、省農(nóng)業(yè)行政主管部門組織完成無公害農(nóng)產(chǎn)品產(chǎn)地認(rèn)定(包括產(chǎn)地環(huán)境監(jiān)測(cè))，并頒發(fā)《無公害農(nóng)產(chǎn)品產(chǎn)地認(rèn)定證書》；
2、省級(jí)承辦機(jī)構(gòu)接收《無公害農(nóng)產(chǎn)品認(rèn)證申請(qǐng)書》及附報(bào)材料后，審查材料是否齊全，完整，核實(shí)材料內(nèi)容是否真實(shí)、準(zhǔn)確，生產(chǎn)過程是否有禁用農(nóng)業(yè)投入品使用和投入品使用不規(guī)范的行為；
3、無公害農(nóng)產(chǎn)品定點(diǎn)檢測(cè)機(jī)構(gòu)進(jìn)行抽樣、檢測(cè)；
4、農(nóng)業(yè)部農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全中心所屬專業(yè)認(rèn)證分中心對(duì)省級(jí)承辦機(jī)構(gòu)提交的初審情況和相關(guān)申請(qǐng)資料進(jìn)行復(fù)查，對(duì)生產(chǎn)過程控制措施的可行性、生產(chǎn)記錄檔案和產(chǎn)品《檢驗(yàn)報(bào)告》的符合性進(jìn)行審查；
5、農(nóng)業(yè)部農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全中心根據(jù)專業(yè)認(rèn)證分中心審查情況，組織召開“認(rèn)證評(píng)審專家會(huì)”進(jìn)行最終評(píng)審。
6、農(nóng)業(yè)部農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全中心頒發(fā)認(rèn)證證書、核發(fā)認(rèn)證標(biāo)志，并報(bào)農(nóng)業(yè)部和國(guó)家認(rèn)監(jiān)委聯(lián)合公告。