未來再生醫(yī)學中心嚴謹?shù)幕驒z測流程包括如下步驟:樣本接收、核酸提取、文庫構建、質(zhì)量控制、測序分析、測序數(shù)據(jù)處理、遺傳咨詢師解讀等標準步驟,為健康譜寫精準說明書。
樣本接收
采集的血液標本將被直接送到未來再生醫(yī)學中心基因?qū)嶒炇疫M行分類,計算機錄入,然后送入核酸提取區(qū)進行血漿分離程序。需要提到的是,未來再生醫(yī)學中心的采血管是來自美國streck公司的核心技術,可在采血后常溫14天內(nèi)仍然保持血液不變質(zhì),管內(nèi)排除了DNA的核酸酶的介導降解,有助于cfDNA的整體穩(wěn)定。
核酸提取
負責cfDNA提取。在基因?qū)嶒炇已和ㄟ^高速離心的方式分離成血漿與血清,而在血漿中極其微量的cfDNA都將被完整保留下來。
這道程序首先有賴于未來再生醫(yī)學中心使用的Eppendorf 德國低溫高速離心機,該離心機具有轉(zhuǎn)速穩(wěn)定,冷卻時間短的特點,在10分鐘就內(nèi)完成高效的血漿分離程序,保障標本在分離過程中不被損壞。再次,從已經(jīng)分離的血漿中提取微量的cfDNA,未來再生醫(yī)學中心采用美國Life公司的cfDNA提取盒,這個試劑盒能能讓未來再生醫(yī)學中心從每毫升血漿中提取出10ng的cfDNA,,也就是億分之一克的含量。
文庫構建
所謂文庫構建就是在未來再生醫(yī)學中心之前獲取的每個cfDNA上在納米級層次上連接上標準化DNA片段,通過這個步驟,cfDNA才能接入測序儀上樣格式進行測試。這個過程也是通過測序儀配套的Life公司的文庫構建試劑盒實現(xiàn)的,具有建庫高效率,標準化的特點。
質(zhì)量控制
最終測序之前,未來再生醫(yī)學中心的檢測環(huán)節(jié)是有質(zhì)量控制步驟的。未來再生醫(yī)學中心前端建立的文庫,通過美國的 Agilent2100生物分析儀與美國Life 公司的Qubit3.0 熒光計,檢測cfDNA是否已經(jīng)正確連接上了標準化的DNA接頭。這個識別過程也是納米級的,可以對單獨的未接上接頭的cfDNA分子進行排查。如果不達標準,未來再生醫(yī)學中心將進行重新建庫,未來再生醫(yī)學中心只對只有完整的接頭的cfDNA進行測序分析。
測序分析
在測序分析區(qū),cfDNA將被注入測序儀器當中,全自動化完成其序列分析工作。未來再生醫(yī)學中心的測序儀采用的是美國Ion proton測序儀面向中國市場推出的DA8600型號,該機器在美國具有FDA認證,國內(nèi)也符合CFDA標準,其高通量測序一次可測達80兆個DNA片段,得到10GB的DNA信息,完全可用于醫(yī)療級別的基因檢測服務。
測序數(shù)據(jù)處理
對于測序所得的DNA序列信息,未來再生醫(yī)學中心的專業(yè)生物信息工程師通過全球權威的UCSC,NCBI等基因數(shù)據(jù)庫,對客戶的DNA信息進行整合,與標準基因序列信息進行對比,得出突變位點。
遺傳咨詢師解讀
未來再生醫(yī)學中心的遺傳咨詢師根據(jù)這些位點,結合美國COSMIC,F(xiàn)DA等腫瘤突變、藥物注冊等數(shù)據(jù)庫,出具標準化分析報告,為客戶的解讀其基因突變與疾病的關聯(lián)。