一、開機
1、開啟主機穩(wěn)壓電源和空氣壓縮機。
2、打開冷卻循環(huán)水系統(tǒng)，設(shè)置水溫為20℃。
3、打開電鏡主機電源，真空系統(tǒng)自動運行30分鐘，儀器待用。
二、樣品安裝
1、將裝有銅網(wǎng)的樣品桿插入樣品室，打開預(yù)抽開關(guān)至綠燈亮，然后順時針轉(zhuǎn)→推→轉(zhuǎn)樣品桿，最后緩慢送入觀察位置。
2、取出樣品前，先關(guān)閉燈絲電流，然后向外抽→轉(zhuǎn)→抽→轉(zhuǎn)樣品桿，關(guān)閉預(yù)抽開關(guān)，待放氣后向外抽離鏡筒。
三、圖像獲得
1、打開高壓，待束流數(shù)值穩(wěn)定，生物樣品選擇高壓值60kV或80kV。
2、打開燈絲電流開關(guān)，燈絲電流自動達到飽和，熒光屏上出現(xiàn)圖像。
3、在左控制板上用放大倍率開關(guān)選擇放大倍數(shù)，用聚焦鈕聚焦圖像，亮度鈕節(jié)亮度，光斑對中按下對中鈕并用鼠標右鍵。
四、鏡筒合軸
1、按照計算機設(shè)定的標準合軸程序進行。
2、在高倍模式下調(diào)整電壓中心，5 萬倍以上進行物鏡消像散操作。
五、底片安裝
1、關(guān)閉燈絲電流和高壓，打開照相室放氣閥。
2、取出兩個底片盒，裝入經(jīng)過預(yù)抽室抽真空12小時以上的新底片盒，關(guān)閉照相室門自動抽真空。
六、觀察和照相
1、用軌跡球或按鈕移動樣品，找到合適視野，放大至所需倍數(shù)，用小熒光仔細聚焦，觀察圖像無漂移，調(diào)整亮度至爆光時間為2秒。
2、在底片上輸入樣品名稱等，按PHOTO按鈕照相。
七、關(guān)機
1、依此關(guān)閉燈絲電流和高壓，再關(guān)閉鏡筒電源和高壓電源，關(guān)閉電鏡主機電源。
2、待主機延時停機后，依次關(guān)閉穩(wěn)壓電源、空氣壓縮機、冷卻循環(huán)水系統(tǒng)。
3、通常情況下儀器晚上不關(guān)機，下班前只要關(guān)閉燈絲電流和高壓，關(guān)閉鏡筒電源和高壓電源，關(guān)閉顯示器即可。
4、在記錄本上記錄使用情況。