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中科曙光攜手中科院動(dòng)物所共同破解“生物奧秘”

   2020-11-09 中國(guó)食品網(wǎng)16660
      今年爆發(fā)的東非蝗蟲災(zāi)害十分的嚴(yán)重,蝗災(zāi)對(duì)糧食帶來的毀滅性后果實(shí)在可怕。人類對(duì)于這類“生物天災(zāi)”真的無可奈何嗎?我國(guó)中科院動(dòng)物研究所在20多年的苦心專研后終于發(fā)現(xiàn)了蝗蟲成災(zāi)的奧秘,《自然》雜質(zhì)在8月份發(fā)表了中科院動(dòng)物研究破解“生物奧秘”的研究成果,而中科曙光為此次破解“生物奧秘”的研究提供了強(qiáng)有力的技術(shù)支持。

 

成果取得的背后,是科研人員大量的生物基因數(shù)據(jù)分析工作,龐大的計(jì)算需求也由此涌現(xiàn)出。中科曙光近期中標(biāo)中科院動(dòng)物研究所,讓先進(jìn)計(jì)算集群系統(tǒng)在研究所發(fā)揮效用,助力研究所針對(duì)蟲害鼠成災(zāi)與控制問題展開生物基因研究,會(huì)有越來越多“生物奧秘”得到破解。

劇研究成果表明。首次從化學(xué)分析、行為驗(yàn)證等多個(gè)層面對(duì)飛蝗群居信息素進(jìn)行了全面鑒定和驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)和確立飛蝗群聚信息素4VA,而之前報(bào)道已知的其它化合物都不具備群聚信息素的所有條件,該項(xiàng)研究范式將化學(xué)生態(tài)學(xué)的研究提升到一個(gè)新臺(tái)階。

中科曙光先進(jìn)計(jì)算集群系統(tǒng)為動(dòng)物所提供有力支持,根據(jù)重大害蟲害鼠成災(zāi)與控制的關(guān)鍵科學(xué)問題,揭示其種群的時(shí)間、空間和遺傳動(dòng)態(tài),并闡述了其對(duì)環(huán)境脅迫因子的適應(yīng)性對(duì)策。害蟲害鼠與植物和天敵協(xié)同進(jìn)化的新模式也由此被發(fā)現(xiàn)。全球變化環(huán)境下生態(tài)管理的理論與技術(shù)體系由此而建立。

打破數(shù)據(jù)分析瓶頸,豐富計(jì)算資源推動(dòng)生物研究

基因組學(xué)數(shù)據(jù)具有單個(gè)文件大、覆蓋面廣、測(cè)序深度深的基本特征。當(dāng)下需要解決的重要問題就是現(xiàn)有的海量昆蟲基因組學(xué)數(shù)據(jù),以及昆蟲生態(tài)學(xué)大文件的存儲(chǔ)問題。

另外,數(shù)量較大的小文件傳輸,會(huì)產(chǎn)生的I/O負(fù)載瓶頸。小文件在數(shù)據(jù)分析過程中量非常大,無論是基因組學(xué)還是生態(tài)學(xué)都需要處理,數(shù)據(jù)分析的瓶頸之一就是現(xiàn)有資源的I/O負(fù)載太高。

中科曙光所先進(jìn)計(jì)算集群系統(tǒng)在動(dòng)物所的成功搭建,可為動(dòng)物所提供高達(dá)100TFlops強(qiáng)大浮點(diǎn)計(jì)算能力。搭建胖節(jié)點(diǎn),刀片計(jì)算節(jié)點(diǎn),登錄和管理節(jié)點(diǎn),存儲(chǔ)IO節(jié)點(diǎn),存儲(chǔ)陣列,交換機(jī),并行文件系統(tǒng),作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)以及整體機(jī)柜都包括在整套儀器內(nèi)。它能為動(dòng)物所提供有力的算力支撐,加快其開展重大害蟲害鼠成災(zāi)與控制的相關(guān)研究進(jìn)程。

中科曙光將在未來為更多國(guó)內(nèi)的科研團(tuán)隊(duì)提供先進(jìn)算力支持,助力我國(guó)科研事業(yè)快速發(fā)展。

 
 
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