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玉米基因組更詳細圖譜出爐

   2017-08-22 科技日報2740
核心提示:核心提示:美國研究人員12日在《自然》雜志網(wǎng)絡(luò)版上發(fā)表論文稱,他們利用新一代測序技術(shù)對玉米自交系B73進行測序,得到了新的、更詳細的基因組圖譜。研究顯示,玉米具有良好的表型可塑性,不同品系玉米的基因組差異明顯。這意味著在全球氣候環(huán)境變化不斷加劇的情況下,玉米仍有巨大的發(fā)展空間。
    美國研究人員12日在《自然》雜志網(wǎng)絡(luò)版上發(fā)表論文稱,他們利用新一代測序技術(shù)對玉米自交系B73進行測序,得到了新的、更詳細的基因組圖譜。研究顯示,玉米具有良好的表型可塑性,不同品系玉米的基因組差異明顯。這意味著在全球氣候環(huán)境變化不斷加劇的情況下,玉米仍有巨大的發(fā)展空間。

 

    玉米是生物學(xué)研究中的重要模式植物。2009年,美國冷泉港實驗室研究人員和愛荷華州立大學(xué)等機構(gòu)研究人員合作,完成了對玉米自交系B73的基因組序列的測定,轟動一時。但當(dāng)時使用的測序技術(shù)并不完備,無法解決玉米基因組中大量的重復(fù)序列,錯過了基因間的大量區(qū)域,也無法準(zhǔn)確捕捉到諸多細節(jié)。

 

    此次,冷泉港實驗室研究人員和加州門洛帕克太平洋生物科學(xué)公司等機構(gòu)合作,使用單分子實時測序和高分辨率光學(xué)制圖技術(shù),通過解讀長測序,構(gòu)建了新的、更詳細的B73基因組圖譜。新技術(shù)讓研究人員能對玉米基因間區(qū)域進行詳細的觀察,從而了解這些基因是如何受調(diào)控的。而新的基因組圖譜也顯示出前所未有的細節(jié),讓研究人員對玉米基因表達的變異性有了更深刻的認(rèn)識。

 

    通過比較新的B73系基因組圖譜與在不同氣侯條件下生長的W22系和Ki11系基因組圖譜,研究人員發(fā)現(xiàn),后兩個品系的基因組與B73的基因組差異巨大,平均只有35%的部分匹配一致。這種差異不僅表現(xiàn)在基因序列變化方面,還表現(xiàn)在基因表達的時間、位點以及表達水平方面。這表明,玉米基因組具有良好的表型可塑性,也意味著其環(huán)境適應(yīng)能力極強。

 

    研究人員指出,卓越的表型可塑性意味著玉米可以使用更多的組合來適應(yīng)環(huán)境變化,這是育種者的福音。在全球人口不斷增加、氣候變化問題不斷加劇的背景下,玉米作為主要糧食作物,仍有巨大的潛力可挖。

 

 
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