香港中文大學(xué)林漢明團隊和華大基因等多家機構(gòu)合作，完成全球首個野生大豆高質(zhì)量參考基因組解析。該成果為挖掘野生大豆遺傳資源和改良、優(yōu)化栽培大豆品種提供了重要依據(jù)。相關(guān)成果近日在線發(fā)表于《自然—通訊》。
“大豆的基因組含有大量重復(fù)區(qū)，組裝時困難重重。我們整合了幾種最新測序方法產(chǎn)生大量數(shù)據(jù)，才最終把問題解決。”林漢明告訴《中國科學(xué)報》。
他帶領(lǐng)的團隊在2010年率先完成了31個野生大豆和栽培大豆的測序；隨后在2014年首次成功利用基因測序方法，獲得野生大豆耐鹽基因，并成功應(yīng)用產(chǎn)生新大豆耐逆品種。
在最新研究中，團隊針對野生大豆W05，應(yīng)用多種最新測序方法產(chǎn)生大量數(shù)據(jù)，最終組裝得到染色體級別的參考基因組。
“野生大豆基因組組合可在比較基因組和進化研究中幫助尋找重要基因，最終幫助改良栽培大豆性狀，并研發(fā)出高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、耐逆大豆。”林漢明說。
相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1038/s41467-019-09142-9
