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黑龍江所“瓦氏雅羅魚(yú)極端鹽堿環(huán)境適應(yīng)的基因組基礎(chǔ)研究”取得重要進(jìn)展

   2021-08-01 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院16360
  在國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金、黑龍江省自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的資助下,黑龍江水產(chǎn)研究所鯉科魚(yú)類基因組學(xué)團(tuán)隊(duì)常玉梅研究員等人開(kāi)展的瓦氏雅羅魚(yú)在極端鹽堿環(huán)境下的適應(yīng)性分子機(jī)制研究取得重要進(jìn)展,相關(guān)研究成果“Resequencing and SNP discovery of Amur ide (Leuciscus waleckii) provides insights into local adaptations to extreme environments”發(fā)表于《Scientific Reports》(IF=4.379) (https://doi.org/10.1038/s41598-021-84652-5)。
 
  我國(guó)內(nèi)蒙古高原東部達(dá)里湖是典型的高碳酸鹽型半咸水湖泊,瓦氏雅羅魚(yú)達(dá)里湖種群與其它淡水種群不同,能夠耐受該湖極端的不良環(huán)境并形成優(yōu)勢(shì)種群,獨(dú)特的地質(zhì)和演化歷史使瓦氏雅羅魚(yú)成為了研究硬骨魚(yú)類適應(yīng)極端環(huán)境的理想模型。該研究采集了達(dá)里湖高堿耐受種群、鄰近姊妹湖崗更湖淡水種群、松花江淡水種群個(gè)體,從基因組尺度深入解析達(dá)里湖瓦氏雅羅魚(yú)極端鹽堿環(huán)境的適應(yīng)性機(jī)制。通過(guò)深度基因組重測(cè)序和遺傳變異信息的挖掘,消除空間背景差異聚焦異質(zhì)水環(huán)境,群體遺傳結(jié)構(gòu)和適應(yīng)性進(jìn)化研究發(fā)現(xiàn),一些與離子和滲透壓調(diào)節(jié)、血管發(fā)育、炎癥免疫反應(yīng)等過(guò)程相關(guān)的關(guān)鍵基因受到較強(qiáng)的正向選擇壓力,參與鹽堿局域適應(yīng)。其中達(dá)里湖種群的血管活性腸肽受體基因vipr1多個(gè)位點(diǎn)受到強(qiáng)選擇,使其編碼蛋白具有更高效的配體結(jié)構(gòu)域,可能通過(guò)VIPR1-PACAP/VIP-PRL-NCC軸參與Na+/Cl-離子轉(zhuǎn)運(yùn)。
 
 
  該研究揭示了達(dá)里湖瓦氏雅羅魚(yú)適應(yīng)極端環(huán)境的遺傳基礎(chǔ),也為耐堿魚(yú)類新品種選育提供了有價(jià)值、可利用的基因元件。
 
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