日本對農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全相當重視，其法律法規(guī)也較為健全，1999年日本國會通過了有關(guān)糧食、農(nóng)業(yè)、農(nóng)村的基本法，提出了有關(guān)提高食品安全性、確保食品品質(zhì)、重視消費者需求的條款。農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全方面的立法包括食品衛(wèi)生、農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量、投入品（農(nóng)藥、獸藥、飼料添加劑等）、動物防疫、植物保護等5個方面。
日本直接對社會發(fā)生行政執(zhí)法行為的部門只有兩家，即農(nóng)林水產(chǎn)省和厚生勞動省；日本農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全標準主要分兩類，一類是安全衛(wèi)生標準，包括動植物疫病、有毒有害物質(zhì)殘留等；一類是質(zhì)量標準。日本厚生勞動省頒布了2000多個品種、1000多個殘留限量標準；農(nóng)林水產(chǎn)省已頒布7類、351種品質(zhì)規(guī)格標準。
為了具體落實基本法，日本國會通過了《流通三法》，即《特定農(nóng)產(chǎn)品加工經(jīng)營改善臨時措施法部分修正的法律》、《批發(fā)市場法以及食品流通結(jié)構(gòu)改善促進法部分條款修正的法律》和《關(guān)于農(nóng)林物資規(guī)格化及其品質(zhì)正確標記部分修正的法律》（簡稱修正JAS法）。
據(jù)報道，修正JAS法實施后，農(nóng)林物資規(guī)格調(diào)查會經(jīng)過多次討論，公布了有機農(nóng)產(chǎn)品（食品）的特定JAS規(guī)格，修正JAS法規(guī)定，有機農(nóng)業(yè)的栽培條件是，果樹和茶在收獲前3年、蔬菜和稻米等在播種前2年不使用農(nóng)藥和化學肥料，但轉(zhuǎn)基因作物和有放射線照射的作物除外。與此同時，被許可的有關(guān)肥料、土壤改良資料、農(nóng)藥、調(diào)節(jié)用的生產(chǎn)資料也有相應的規(guī)定。
另外，規(guī)定在加工食品中，有機農(nóng)產(chǎn)品的比重必須占95％以上，對可以使用的食品添加劑和藥劑也有相應的規(guī)定。在標簽上，必須標有“有機農(nóng)產(chǎn)品”、“有機栽培農(nóng)產(chǎn)品”、“有機××”等字樣。如果是處于轉(zhuǎn)換期間的，應在名稱的前面或后面標有“轉(zhuǎn)換期間”。
在規(guī)定必須標明有機農(nóng)產(chǎn)品（食品）規(guī)格的同時，農(nóng)產(chǎn)品（食品）是否確實按照所規(guī)定的標準進行栽培的，必須接受第三者的認定和證明。根據(jù)修正JAS法的規(guī)定，被農(nóng)林水產(chǎn)大臣指定的登記認定機關(guān)，可以對食品制造商、生產(chǎn)者（生產(chǎn)工程管理者）和進口商的農(nóng)產(chǎn)品（食品）進行認證。并且規(guī)定接受認證的業(yè)主有標記的義務。關(guān)于認定機關(guān)審查（認定）者的資格，規(guī)定大學畢業(yè)生必須有從事有機農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)3年以上經(jīng)驗，高中畢業(yè)生必須有4年以上經(jīng)驗、并且在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)有指導、檢查、試驗研究方面的經(jīng)驗。沒有學歷的，則必須有5年以上從事農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的經(jīng)驗。
日本對進口農(nóng)產(chǎn)品、畜產(chǎn)品以及食品類的檢疫防疫制度非常嚴格，對于入境農(nóng)產(chǎn)品，首先由農(nóng)林水產(chǎn)省下屬的動物檢疫所和植物防疫所從動植物病蟲害角度進行檢疫。同時，由于農(nóng)產(chǎn)品中很大部分用作食品，在接受動植物檢疫之后，還要由日本厚生勞動省下屬的檢疫所對具有食品性質(zhì)的農(nóng)產(chǎn)品從食品角度進行衛(wèi)生防疫檢查等。
日本推廣身份證制度，至少有三個目的：一是為了食品安全。農(nóng)產(chǎn)品有了身份證，消費者一看便知是不是本國蔬菜，是不是綠色食品，有沒有農(nóng)藥殘留，新鮮不新鮮。二是突出特點，在激烈的農(nóng)產(chǎn)品競爭中以質(zhì)取勝。
由于氣候和土壤的不同，日本各地在蔬菜水果方面都有自己的特產(chǎn)，如岐阜縣的甜瓜，加賀市的蔬菜等，只要身份證上標明產(chǎn)地，立刻就會出現(xiàn)品牌效應。即使價錢高一些人們也會接受。三是利用身份證保護本國農(nóng)產(chǎn)品。由于日本農(nóng)產(chǎn)品價格太貴，日本人基本上已經(jīng)接受來自外國的農(nóng)產(chǎn)品，特別是中國蔬菜，日本農(nóng)產(chǎn)品在一定程度上受到了沖擊。（中國漁網(wǎng)）
